Тюрьма на территории закрытого Богородице-Казанского женского монастыря в Барнауле (Канатный проезд, 81) была организована в 1925; в наши дни здесь располагается одно из учреждений УФСИН по Алтайскому краю (СИЗО-1). В 1930-е тюрьма находилась в ведомстве НКВД. Местным жителям было известно о наличии расстрельных ям в сосновом бору у стен бывшего монастыря, периодически здесь обнаруживались вышедшие на поверхность кости. По мнению С.М. Кобзева, сотрудника барнаульского Музея «Город», одно из бывших монастырских строений служило накопителем перед расстрелом, отсюда приговоренных выводили в лес через калитку в тюремной стене. В 1989 студентами-историками разных барнаульских вузов (участники раскопок - Владимир Рыжков, Валерий Савинков, Геннадий Глиос и др.) было проведено обследование местности. Непосредственным импульсом стало очередное обнаружение костей. Приблизительно в 100 м от тюремного забора было обнаружено не менее 20 могильных ям. Общая площадь захоронений (по визуальной оценке) составляет 60 х 60 м. На основании публикаций в прессе об обнаружении останков Прокуратурой Барнаула было открыто дело. Вскрытие и эксгумация производились прокуратурой, тогда же был составлен план захоронений. По воспоминаниям участника раскопок В. Савинкова, на месте были четко видны провалы (наподобие рвов, длиной около 20 м), как только начали копать, обнаружились кости. Шурфовке было подвергнуто не менее пяти ям. Имеются данные, что было собрано 10 или 20 мешков с костными останками. Также в ямах были обнаружены монеты 1933 и 1935 годов. На месте раскопов был установлен первый памятный знак - деревянный крест. В 1991 останки были перезахоронены в двух братских могилах. Захоронение осуществили члены студенческого строительного отряда «Поиск». На месте захоронения студенты установили стелу с надписью: «Невинно убиенных пусть сила правды воскресит», «Вечная память почившим»; при этом первоначальный крест был сохранен. Осенью 1991 студенты высадили у памятника рябины. Впоследствии рядом с памятником были поставлены еще два православных креста, предположительно их установили верующие, посещающие часовню, находящуюся внизу у источника.

Место памяти имеет статус объекта культурного наследия регионального значения. Официальные церемонии у памятника не проводятся. У крестов регулярно проходят панихиды и заупокойные литии. Весной 2001 здесь же были обнаружены фрагменты трех женских скелетов. В Барнаульской епархии полагают, что это останки монахинь Богородице-Казанского монастыря, которые были расстреляны в 1920-е, после того, как монастырь был закрыт.