С 1934 до начала 1950-х в Московском крематории на территории Донского монастыря осуществлялась кремация тел расстрелянных в московских тюрьмах, эпизодически (в основном в 1937) здесь же производились захоронения в землю. Захоронения происходили в непосредственной близости от крематория. Прах захоранивали в общие ямы – так называемые «захоронения невостребованных прахов». В северной части кладбища в наши дни имеются три таких могилы: первая датируется «с 1930 г. – 1942 г. включ.», вторая: «с 1943 г. – 1944 г. включ.», третья – «1945–1989». В августе 1991 на «общей могиле № 1» была установлена гранитная плита с надписью «Здесь захоронены останки невинно замученных и расстрелянных жертв политических репрессий 1930-1942. Вечная им память!». В 1994 – на «общей могиле № 3» – стела с текстом: «Павшим жертвам политических репрессий. 1945–1952. Вечная память». Впоследствии на кладбище появились многочисленные коллективные и личные мемориальные комплексы, памятники и памятные знаки. В «Расстрельных списках» Донского кладбища (М.: «Мемориал», 2005) приводятся краткие биографические справки на 5068 человек.